Bakteriese plantsiektes

Opsomming

BBSRC, ook namens die Departement vir Omgewing, Voedsel en Landelike Sake (Defra), die Natuurlike Omgewingsnavorsingsraad (NERC) en die Skotse regering, kondig 'n oproep aan vir navorsing om bedreigings vir Britse plantgesondheid en biosekuriteit van bakteriële siektes aan te spreek. Voorstelle word ingewag vir multidissiplinêre en interdissiplinêre studies van bakteriese plantpatogene en hul interaksies met gasheerplante, ongewerwelde diere vectors en die breër omgewing.

Hierdie oproep is die tweede fase van 'n wyer program oor bakteriese plantsiektes, ondersteun deur die UK Research and Innovation (UKRI) Strategic Priorities Fund (SPF). Dit sal die werk aanvul van die onlangs gestigte BRIGIT-konsortium waarop gefokus is Xylella fastidiosa deur studies oor verskillende siektes te finansier.

agtergrond

Daar is toenemende kommer oor potensiële en bestaande bedreigings vir Britse plant (insluitend boom) gesondheid en biosekuriteit van die wyer verspreiding en meer algemene voorkoms van beide opkomende en inheemse bakteriese siektes. Bydraende faktore sluit in omgewingsverandering en groter beweging van potensieel besmette plante of plantmateriaal in die handel. Hierdie patogene (en hul ongewerwelde diere vectors) gewasproduksie, bosbou, kommersiële en geriefstuinbou, sowel as bosvelde en breër biodiversiteit binne die breër omgewing bedreig. Hulle het die potensiaal om wydverspreide en ernstige ekonomiese, omgewings- en sosiale impakte op landskappe en ekosisteme, beide landelik en stedelik, te veroorsaak.

Bakteriële fitopatogene is uiteenlopend en veroorsaak baie soorte siektes. Hul oordrag kan in die lug, grond of via ongewerwelde diere wees vectors. Wanneer hulle aan nuwe gebiede bekendgestel word, is hul verspreiding onvoorspelbaar, maar dikwels hoogs indringend. Hulle is moeilik om met chemikalieë te beheer en, anders as baie ander plantpatogene, het hulle dikwels 'n groot aantal potensiële gashere.

Kommer word versterk deur 'n relatiewe gebrek aan navorsing oor bakteriese fitopatogene, vererger deur die beskikbaarheid van beperkte wetenskaplike vermoë en die vermoë om te reageer op die uitdagings wat dit bied. Die patogene is dikwels moeilik om te bestudeer: infeksie kan latent en simptoomloos wees, terwyl sommige patogene buite die plantgashere 'onkweekbaar' is.

Defra se Plantgesondheidsrisikoregister bevat inligting oor baie bakteriese patogene, en meer patogene word bygevoeg, aangesien dit 'n risiko word. Hierdie oproep fokus nie uitsluitlik op die bakteriese siektes wat in die register opgeneem word nie, maar aansoekers kan dit as 'n nuttige inligtingsbron vind.

Doel

Die doel van hierdie oproep tot voorstelle is om multidissiplinêre en interdissiplinêre navorsing te ondersteun om die hantering van bedreigings vir die gesondheid van plante in die Verenigde Koninkryk weens bakteriese siektes wat potensieel ernstige gevolge het vir gekweekte plante of die natuurlike omgewing, te verstaan ​​en in te lig. Dit het ten doel om die behoeftes van beleidmakers en praktisyns aan te spreek deur wetenskaplike geleenthede te benut om leemtes in kennis van die biologie en epidemiologie van hierdie siektes aan te spreek om die antwoorde te optimaliseer om dit teë te werk.

Die oproep het ook ten doel om vermoë en kapasiteit vir navorsing oor bakteriële siektes te verhoog deur kundigheid in plantpatologie saam te bring met die nuutste genomiese en ander tegnologieë, en navorsing in ander dissiplines. Waar toepaslik, moet hierdie navorsing gebruik maak van relevante benaderings uit ander velde, veral in 'n breër omgewingskonteks, om die interaksies tussen patogene, hul gashere en vectors, en wyer ekosisteme.

Die portefeulje van befondsde projekte sal aktief bestuur word om kennisuitruiling te bevorder - tussen projekte en met belanghebbendes - om geleenthede vir sinergie te benut en om relevant te wees vir gebruikersbehoeftes.

Omvang

Hierdie oproep is die tweede fase van 'n wyer program oor bakteriese plantsiektes wat deur die SPF ondersteun word, met bykomende bydraes van Defra en die Skotse regering. Dit dek alle soorte bakteriese patogene (insluitend fitoplasmas) wat gekweekte of ander (landelike of water) plante (insluitend bome) van kommersiële, omgewings-, sosiale of kulturele betekenis en waarde in die Verenigde Koninkryk beïnvloed of bedreig.

Om die biologie van bakteriële patogene en hul komplekse interaksies met gasheerplante, ongewerweldes te verstaan vectors en die breër omgewing, sal voorstelle op kundigheid uit 'n verskeidenheid navorsingsdissiplines moet put. Dit kan bakteriologie, ekologie, entomologie, epidemiologie, genomika, modellering, plantpatologie, sosiale wetenskap en enige ander relevante navorsingsgebiede insluit. Innoverende interdissiplinêre benaderings wat verskillende tipes kundigheid integreer, sal veral verwelkom word.

Behalwe dat dit wetenskaplik uitstekend is, moet die navorsing wat gefinansier moet word, ook strategies relevant wees vir die behoeftes van potensiële gebruikers: die regering, statutêre agentskappe, die sakewêreld, die industrie en nie-regeringsorganisasies. Daar word van belanghebbendes verwag om betrokke te wees by die ontwerp en lewering van projekte om hul relevansie vir beleid en praktyk te verseker.

Daarbenewens moet voorstelle aantoon hoe dit die Britse vermoë en vermoë om navorsing oor bakteriese plantsiektes te verhoog, sal verhoog.

Voorstelle word uitgenooi vir projekte om uitdagings onder een of meer van die volgende temas aan te spreek, maar dit is nie bedoel om voorskriftelik of eksklusief te wees nie:

Effekte van omgewingsverandering

Veranderinge in die omgewing en die bestuur daarvan sal waarskynlik lei tot veranderinge in die manier waarop bakteriese patogene versprei en hul gashere beïnvloed. Veranderinge in temperatuur, reënvalpatrone, CO₂ konsentrasies, insek vector gedrag, grondgebruik en boerderygedrag kan almal die manier beïnvloed waarop die gasheer aan die patogeen blootgestel word, en inderdaad of 'n bakteriese siekte gevestig sal word nadat dit die VK vir die eerste keer bereik het. Aansoeke om die uitwerking van veranderende omgewings op bakteriële siektes te bestudeer, sal belanghebbendes help om bakteriële siektes nou en in die toekoms te verstaan ​​en voor te berei.

Oordrag tussen gashere

Een van die grootste bekommernisse oor sommige bakteriële siektes is hul neiging om 'n besonder wye verskeidenheid gasheerplante te beïnvloed. Om nie net die gasheerreeks van 'n patogeen te verstaan ​​nie, maar hoe dit nuwe gashere kan beïnvloed, kan ons kennis gee wat gebruik kan word om infeksie van verdere gashere te voorkom. Verstaan ​​die rol van vectors betrokke by die oordrag van die siekte en infeksie van plante sal ook die sleutel tot die ontwikkeling van maniere wees om die impak van hierdie siektes te verminder.

Faktore wat patogeniteit beïnvloed

Om 'n bakteriese siekte in 'n gasheerplant te laat posvat, moet die bakterie die gasheer teëkom in 'n vorm waar infeksie kan plaasvind. Aansoeke word verwelkom om die lewensiklus van die patogeen te verstaan, en wat dit veroorsaak dat dit patogeen is, asook om te verstaan ​​hoe die patogeniteit voorkom. Dit kan 'n rol speel om belanghebbendes in te lig oor die risiko's van besmetting, insluitend ingevoerde plantmateriaal.

Effekte van gronde / grondmikrobioom

Grond kan verskillende rolle speel in die oordrag en vestiging van bakteriese siektes van plante. Patogene bakterieë kan in grond leef en gasheerplante wat daar groei, besmet, en in teenstelling met patogene wat die boonste dele van plante beïnvloed, is dit moeilik om grondgedraagde bakterieë te behandel. Verder kan siektes versprei word deur organismes wat in die grond woon, soos aalwurms en naaktslak. Grondtoestande, insluitend die grondmikrobioom, kan ook 'n uitwerking hê, maar daar is min navorsing gedoen op hierdie gebied, en toepassings om die rol van grond in bakteriese siektes van plante te bestudeer, word verwelkom.

Begrip van gasheerweerstand en vatbaarheid

Die meganismes waardeur plantgashere die aanval van bakteriese patogene weerstaan, is bestudeer, maar dit is nie altyd duidelik waarom een ​​gasheerspesie vatbaar is vir 'n bakteriese siekte nie, terwyl 'n ander spesie grotendeels bestand is. Die begrip van weerstand teen die gasheer val binne die bestek van hierdie oproep, maar toepassings wat hoofsaaklik op teelbestande soorte gewasse gefokus is, sal van die hand gewys word.

Die navorsing wat gefinansier moet word, moet binne BBSRC en / of NERC se verpligting wees en moet 'n wesenlike element van ondersoekende biologiese en / of omgewingswetenskap insluit. Maar om hul relevansie vir belanghebbendes en potensiaal vir impak te verseker, moet voorstelle rekening hou met die ekonomiese en sosiale kontekste van die plantgesondheidsuitdagings wat hulle wil hanteer. Met dien verstande dat dit nou geïntegreer is met ander aspekte van die voorgestelde werk, kan projekte ook toepaslike elemente van ekonomiese analise of sosiale wetenskap insluit.

Die eerste fase van die SPF-program vir bakteriese plantsiektes is 'n geïntegreerde multidissiplinêre werk van £ 5 miljoen Xylella fastidiosa deur die BRIGIT-konsortium van instellings gelei deur die John Innes-sentrum. Terwyl aanvullende navorsing oor X. irriterend is nie uitgesluit van die huidige oproep nie, moet die voorgestelde werk onderskeidend wees van en aanvullend is tot BRIGIT en ander bestaande studies, insluitend die XF-ACTORS en POnTE-projekte wat ondersteun word deur die Horizon 2020-program van die Europese Unie. Voorstelle moet die toegevoegde waarde demonstreer deur sinergie met voortgesette aktiwiteite.

Daar word verwag dat voorstelle vir navorsing oor die rolle van bakterieë in siektes van eikebome ooreenstem met die prioriteite van en die Action Oak-vennootskap. Defra het aangebied om 'n ondersteuningsbrief te gee vir voorstelle wat die doelstellings van Action Oak hanteer. Kontak Sarah Jeffery by info@actionoak.org met 'n beskrywing van u voorstel vir meer inligting. 

Navorsing oor die volgende onderwerpe is uitgesluit van hierdie oproep:

• navorsing oor bakteriële besmetting / verval van gewasse na oes
• navorsing met die spesifieke doel om kommersiële teling van plante wat bestand is teen bepaalde bakteriese patogene, moontlik te maak
• ondersoek om interaksies tussen plante en bakteriële patogene van mense en hul rol in die oordrag van siektes aan mense te verstaan.

Projekskaal en duur

Tot £ 13 miljoen is beskikbaar, afhangend van die kwaliteit van die voorstelle wat ontvang is, met die doel om 'n toepaslike breë en gebalanseerde portefeulje van tot 20 projekte te ondersteun. Aansoeke mag nie £ 2.5 miljoen oorskry nie (teen 100% van hul volle ekonomiese koste). Die befondsers beoog om 'n portefeulje van projekte van verskillende groottes en fokusareas te finansier. Grootskaalse multidissiplinêre toepassings word verwelkom, maar kleiner, meer geteikende projekte word nie uitgesluit nie.

Fondse kan tot drie jaar aangevra word, en projekte sal na verwagting op 1 Mei 2020 begin.

Al die projekte word teen 80% van hul volle ekonomiese koste befonds.

Dorpsvergadering

'N Dorpsvergadering is op 21 Junie gehou om potensiële aansoekers en belanghebbendes die geleentheid te bied om meer uit te vind oor die agtergrond van die oproep en te verstaan ​​wat die befondsers hoop om daardeur te ondersteun. Aanbiedings is aangebied deur Jon Knight, Nicola Spence, Saskia Hogenhout en Debbie Harding, en dit is beskikbaar in die afdeling 'Downloads'. 

In aanmerking te kom

Die oproep is oop vir individue wat in aanmerking kom vir organisasies wat normaalweg in aanmerking kom om aansoek te doen vir navorsingstoekennings by UKRI se navorsingsrade. Standaard BBSRC- en NERC-kwalifikasiekriteria is van toepassing, sien aflaaie en NERC: Toegang tot navorsingstoelae.

Slegs vir hierdie oproep: Openbare sektore vir navorsingsinstellings (PSRE's) met tien of meer navorsers met PhD's (of gelykwaardig) kan aansoek doen. As PSRE's wat wil aansoek doen, nie vroeër aansoek gedoen het vir UKRI-befondsing nie en nie tans 'n IRO-status is nie, moet hulle 'n geskiktheidsvorm invul (sien: UK Research and Innovation: Aansoek om aansoek te doen om aansoek te doen by UK Research and Innovation vir navorsingsbefondsing) om te verseker dat hulle oor die nodige navorsingsvermoë, stelsels en kontroles beskik om die navorsing te bestuur en befondsing toe te staan. PSRE-aansoekers moet kontak plant.bakterieë@bbsrc.ukri.org by die vroegste geleentheid om hul belange in die toepassing te bespreek.

Aansoeke wat skoolhoof of mede-ondersoekers insluit wat nie in aanmerking kan kom om aansoek te doen vir finansiering nie, en / of organisasies wat nie in aanmerking kom nie, sal van die hand gewys word.

Oorsese navorsingsinstellings kan samewerkingsvennote in projekte wees, maar kom nie in aanmerking vir direkte finansiering onder die inisiatief nie. Voorstelle vir navorsingstoelae sal nie van oorsese instellings of van Britse aansoekers aanvaar word nie, indien voorstelle versoeke bevat vir direkte finansiering vir oorsese mede-aansoekers (maar sien die afdeling oor subkontraktering hieronder).

Organisasies in die private sektor, liefdadigheidsorganisasies en nie-regeringsorganisasies wat nie die UKRI-goedgekeurde IRO-status het nie, kan as samewerkende vennote deelneem, maar sulke organisasies kom nie in aanmerking om aansoek te doen vir of om direkte finansiering uit hierdie inisiatief te ontvang nie (maar sien die afdeling oor onderaanneming hieronder).

In alle gevalle van samewerkingsaktiwiteite met ander organisasies as die klasse van in aanmerking komende instansies hierbo gelys, moet beide aansoekers en medewerkers / projekvennote bewus wees daarvan dat enige koste, direk of andersins, aangegaan deur medewerkers of instellings van medewerkers (projekvennote) in verband met samewerking, kan nie deur hierdie inisiatief voldoen word nie.

Verdere leiding oor die insluiting van medewerkers en projekvennote is beskikbaar in die BBSRC-toelaaggids (sien die afdeling vir aflaai).

Aspekte van onderkontraktering van die voorgestelde werk aan instansies wat nie in aanmerking kom om direk aansoek te doen vir finansiering nie, as gevolg van byvoorbeeld die gebrek aan toepaslike kundigheid in instansies wat in aanmerking kom, is aanvaarbaar. Aansoekers sal egter moet aantoon dat die deelname van enige subkontrakteur toegang sal verleen tot noodsaaklike vermoëns wat nie geredelik beskikbaar is in 'n kwalifiserende Britse navorsingsorganisasie nie. Gedetailleerde inligting oor subkontraktering is in die BBSRC-toelaaggids.

Rooster

Vooraf aankondiging van die oproep	4 Maart 2019
Begin die oproep	20 Mei 2019
Dorpsvergadering	21 Junie 2019
Aansoek sperdatum	25 Julie 2019
Assesseringsvergadering	Desember 2019 (tbc)
Toekenning vir navorsing	Februarie 2020 (tbc)

Daar is beperkings op die duur van hierdie finansieringsprogram en alle toelaes moet voor of op 1 Mei 2020 begin.

Aansoek- en assesseringsproses

Aansoeke om navorsingstoekennings moet ingedien word deur die Gesamentlike Elektroniese Inleweringstelsel (Je-S) van die navorsingsrade en die assessering daarvan sal deur BBSRC bestuur word. Potensiële aansoekers moet daarop let dat in aanmerking komende individue en instellings op die Je-S-stelsel geregistreer moet wees om aansoek te kan doen. Enige instansie of individu wat in aanmerking kom vir die indiening van 'n voorstel, maar wat nog nie geregistreer is om die stelsel te gebruik nie, moet vroeë registrasie oorweeg en die Je-S Helpdesk kontak (jeshelp@je-s.ukri.org ; 01793 444164).

Aansoekers moet by Je-S aanmeld en kies:

• Raad: BBSRC
• Dokumenttipe: Standaardvoorstel
• Skema: Standaard
• Oproep / tipe / modus: Bakteriese plantsiektesprogram Fase 2

Vir hierdie oproep is 'n addisionele dokument 'Belanghebbende betrokkenheidsplan' nodig. Laai dit asseblief op na u aansoek as aanhangsel tipe 'Ander aanhangsel' in Je-S. Alle ander dokumente word vereis volgens standaardaansoeke, maar vir hierdie oproep moet die bladsylimiet vir die saak vir ondersteuning en rekord 'n maksimum van twaalf kante van A4 wees (bestaande uit twee bladsye van rekord en tien bladsye van die saak vir Ondersteuning).

Aansoeke moet voor 16:00 BST ingedien word op die dag van die sperdatum. Geen uitstel van sperdatums word aanvaar nie. Ons beveel aan dat u vroegtydig indien voor die sperdatum.

Die assesseringskriteria vir voorstelle is soos volg:

• Wetenskaplike uitnemendheid
• Relevansie vir die omvang en doel van die oproep
• Ekonomiese en sosiale impak
• Strategie en beleidsrelevansie
• Waarde vir geld
• Potensiaal vir bouvermoë en kapasiteit
• Belanghebbende betrokkenheid
• Robuustheid en toepaslikheid van die plan vir die bestuur van die projek, veral vir die bestuur van interdissiplinêre konsortiums.

Die befondsers sal die finale besluit neem oor die projekte wat gefinansier moet word op grond van die aanbevelings van die beoordelingspaneel. Die befondsers sal ook die algehele dekking en balans van die werkprogram wat befonds word, in ag neem.

Paaie om te beïnvloed

Aansoekers moet 'n 'Pathways to Impact'-verklaring voltooi as deel van hul aansoek; dit is 'n standaardvereiste vir toekenningsaansoeke van die Navorsingsraad wat as deel van die portuurbeoordelingsproses beskou word. Die finansieringsvennote is gretig dat navorsers wat deur hierdie program gefinansier word, 'n program moet beplan vir betrokkenheid en belang van belanghebbendes wat gedurende die leeftyd van hul projek geïmplementeer sal word. Aansoekers moet deeglik oorweeg hoe die kennis en ervaring wat uit die projek opgedoen is, aan relevante beleidmakers en ander belanghebbendes beskikbaar gestel sal word. Enige ander soort impak wat uit die navorsing voortspruit, moet ook ingesluit word. Sien asseblief Britse navorsing en innovasie: paaie om te beïnvloed.

Aansoekers moet daarop let dat die koste verbonde aan die implementering van projekspesifieke impakaktiwiteite by die toelaag-aansoeke ingesluit kan word. Koste moet ten volle geregverdig word. Die befondsers is veral gretig om impakaktiwiteite te sien wat langer as die leeftyd van die navorsingstoekenning sal strek.

Belanghebbende betrokkenheid

Benewens die Pathways to Impact-dokument, moet aansoekers 'n plan vir betrokkenheid by belanghebbendes indien. Die befondsers wil graag die betrokke betrokkenheidsgroepe se aktiewe betrokkenheid by projekte sien, vanaf die ontwerp van projekte, deur die lewering van die navorsing, en dat die belanghebbendes uiteindelik die uitsette van die navorsing gebruik. Die betrokkenheidsplan vir belanghebbendes moet aandui watter belanghebbendes betrokke gaan wees / waarskynlik, hoe hulle by die projek betrokke sal wees en hoe hul deurlopende behoeftes weerspieël sal word in die lewering van die projek.

Die betrokkenheidsplan vir belanghebbendes sal 'n aparte aanhangsel wees van die Pathways to Impact-dokument en sal tot twee bladsye lank wees.

Jon Knight from AHDB has offered to act as a broker to foster collaborations between applicants and relevant industrial stakeholders; please contact Jon.Knight@ahdb.org.uk vir verdere inligting. 

Befondsings- en verslagdoeningsvereistes

Befondsing wat onder die inisiatief toegeken word, sal deur BBSRC geadministreer word. Dit is onderhewig aan UKRI se standaardbepalings en -voorwaardes vir navorsingstoekennings (sien downloads), tesame met spesifieke addisionele of alternatiewe vereistes wat gesamentlik deur BBSRC en sy befondsingsvennote ooreengekom word (byvoorbeeld met betrekking tot intellektuele eiendom, databestuur en -deling, verslagdoeningsvereistes, openbare betrokkenheid of interaksies met die befondsingsvennootskap).

Projekte wat deur hierdie inisiatief ondersteun word, sal tot drie jaar duur.

Projekte word teen 80% van die in aanmerking komende volle ekonomiese koste (FEC) gefinansier volgens die gebruiklike navorsingsrade.

Die befondsers het die beleid van UKRI aangaande openbare toegang tot navorsingsbevindinge aanvaar (sien: Britse navorsing en innovasie: beleid oor oop toegang), en toelaes sal onder die voorwaardes gefinansier word. Publikasiekoste is nie meer 'n in aanmerking komende koste vir navorsingsraadtoelaes nie.

Die standaardverslagvereistes van navorsingstoelaes wat toegeken word onder die UKRI-bepalings en -voorwaardes, is van toepassing.

Aansoeke sal aan al die befondsers beskikbaar gestel word; inligting oor befondsde toelaes sal op die befondserswebwerwe beskikbaar gestel word.

Kontak Ons

Debbie Harding

plant.bakterieë@bbsrc.ukri.org