Luka Wanjohi is 'n plaaslike senior kennisbestuursgenoot by die International Potato Centre in Uganda en werk saam met die Sweetpotato Genetic Advancement and Innovative Seed Systems (SweetGAINs) -projek. Hy het met die plaaslike kommunikasiespesialis, Vivian Atakos, gesels oor hoe statistieke deurbrake in plantteling aanwakker deur die vaartbelyning van hoe inligting versamel en gedeel word.
V: As 'n mens dink aan statistieke oor planteteelt en data-insameling is dit nie noodwendig die eerste ding wat by jou opkom nie. Watter rol speel databestuur in die ontwikkeling en aanvaarding van verbeterde plantvariëteite?
LW: Data kan beskou word as die kern en siel van navorsingsaktiwiteite. Sweet GAIN's werk in verskillende lande met verskillende vennote, elkeen het 'n ander manier om data in te samel en hul navorsingsaktiwiteite te bestuur. Behoorlike en baie gestandaardiseerde aktiwiteite vir databestuur is nodig om te verseker dat ons daarin slaag om data te gebruik om ons keuse te neem. Planttelers maak staat op data om goeie keuses te neem. Voordat 'n variëteit vrygestel word, wil ons verstaan wat ons vervang. Waarom dink ons is dit nodig dat 'n nuwe variëteit in 'n land nodig is?
Q: Wat is die risiko's om die data wat deur 'n moderne teelprogram gegenereer word, nie te sistematiseer nie?
LW: As ons nie ons data versamel en die eienskappe wat ons versamel op 'n gestandaardiseerde manier definieer nie, word dit moeilik vir ons om data te deel. U sal agterkom dat wanneer u nie 'n stelselmatige manier het om u data te bestuur nie, mense wat nie daar was toe die data gegenereer is nie, dit moeilik sou kon vind om met die data te werk. Laastens beteken dit dat u die risiko loop om baie foute in te stel, data te verloor of beskadigde data in te samel, as u u nie sistematiseer nie. Dit maak dit baie moeilik vir u om hierdie data te gebruik sonder om te doen wat ons noem data curation - 'n duur en vervelige proses. Sommige data sal verlore of onbruikbaar wees, selfs na die kuratorskap.
Die standaardisering van data-insameling en -bestuur help planttelers om op mekaar se werk voort te bou. In die verlede was data-insameling nie van projek tot projek en van terrein tot terrein gestandaardiseer nie, wat gelei het tot waninterpretasie of duur tydverliese (foto: Isabel Corthier/CIP)
V: Waarom is dit belangrik om standaardbedryfsprosedures vir databestuur in plantteling toe te pas?
LW: Die duidelike voordele wat ons sien met betrekking tot die implementering van hierdie standaardbedryfsprosedures (SOP's) is dat ons duidelike standaarde kan stel vir hoë kwaliteit data in terme van die manier waarop ons ons proefontwerpe doen. Ons benadering tot digitalisering hanteer hoe ons data versamel, watter verbeterde toerusting ons gebruik, ensovoorts. Die ander voordeel is dat ons verseker dat die data wat ons versamel, vandag en môre vergelykbare data is in verskillende omgewings en lande.
V: Wat is die uitdagings om nie data in 'n program te standaardiseer nie?
LW: As ons in die toekoms 'n gesamentlike analise wil doen, het ons gestandaardiseerde naamstelsels nodig. Om 'n gevorderde proef uit 'n voorlopige proef te vertel, gebruik ons dieselfde ontologie. 'N Ruk gelede wou ons byvoorbeeld kyk hoe patat retrovirus siekte ons plante beïnvloed, maar dit was 'n uitdaging omdat een groep in die verlede op 'n skaal van een tot vyf kan score, gebaseer op die erns van die effek van 'n virus op die plant. Dan sou ons 'n ander program kry wat op 'n skaal van een tot drie aangeteken is, en 'n ander een met 'n puntestelsel van een tot nege. As ons van die ontologie praat, standaardiseer ons hierdie tellings sodat dit vir programme dieselfde is. Ons gebruik ook BreedBase om die stoor van al ons data te sentraliseer en stel ons in staat om proefdata op te spoor oor verskillende (program) oorgange en vroeg in ons werk potensiële probleme op te spoor, in teenstelling met die feit dat ons die verkeerde data dadelik versamel of gestoor het. baie wanneer u 'n ontleding wil doen.
Q: Hoe help die versameling en bestuur van data telers om voorkeurseienskappe te teiken, hul werk te stroomlyn en algehele koste te verlaag?
LW: 'N Doeltreffende databestuursproses ondersteun die teler in vinnige, koste-effektiewe data-insameling, wat hulle in staat stel om baie data te versamel, te ontleed en besluite te neem om hul werk te ondersteun. Telers werk normaalweg met baie toegang. Ek het proewe in Uganda gesien, waar 'n plot ongeveer 7000 inskrywings gehad het in 'n verhoor van 7000 erwe. As u 'n groot aantal toetredings het, wil u in staat wees om u data vinnig en op 'n doeltreffende manier te versamel. Deur 'n proses in te stel waarmee u dit digitaal kan doen, word papierinskrywings vermy wat die risiko van foutiewe transkripsie van data tydens die digitalisering inhou. Ons gereedskap het ingeboude tjeks om te verseker dat ons die regte data versamel of die invoer van data soveel as moontlik beperk. Slegs die toelaatbare waardes wat dit kan wees, kan versamel word. Dit maak voorsiening vir vinnige data-ontleding omdat dit reeds gedigitaliseer is en dat dit vinnig maklik gedeel kan word met kollegas en ander mense wat help met die data-analise.
V: Vertel ons hoe die gebruik van strepieskodes help om inligting te stroomlyn.
LW: Ons gebruik al 'n geruime tyd baie strepieskode-etikette. Programme word aangemoedig om seker te maak dat hulle etikette vir hul materiaal in die skerms en in die veld druk. Die kern van barcoded label is om die beweging van 'n gegewe toetreding of 'n gegewe genotipe oor verskillende werkvelde te kan opspoor. BreedBase, ons databasis, genereer 'n unieke ID vir elke plot wat u in die veld uitsteek, en ons plaas hierdie ID op die strepieskode, sodat ons die prestasie van 'n gegewe inskrywing van die veld tot die oes kan volg, en wanneer ons bring dit laboratorium toe vir ontleding, ensovoorts.
V: Watter advies het u vir ander organisasies wat die standaardprosedures in hul teelprogramme wil implementeer?
LW: Ons het geleer dat ons SOP's 'n lewende dokument is. Daar was ontwikkeling nodig, want sodra u 'n verwysingsdokument het, word dit maklik vir mense om terug te kom en daarna te kyk en mense wat oor die hele streek versprei is, te ondersteun. My raad aan ander is dat die ontwikkeling moet wees, dit moet deel uitmaak van die aktiwiteite wat u vandag doen. Begin klein, dokumenteer die prosedures soos dit vandag is. Praat met die teelspanne, met die mense wat die teelaktiwiteite eintlik implementeer en streef daarna om hierdie dokument voortdurend te verbeter. Moenie poog om 'n perfekte dokument gereed te hê nie. Begin deur een te skryf en kyk dan saam deur almal in die span om al die prosesse en al die roetine-aktiwiteite in die teelprogram vas te lê. Sodoende sal u met verloop van tyd 'n dokument hê wat so inklusief moontlik is en wat al die aktiwiteite wat u in u program doen, vaslê.
Besoek ons op SoundCloud om na die SweetGAINS podcast met Luka Wanjohi en ander wetenskaplikes wat die plantteling moderniseer.
